观察大肠杆菌时，主要使用的显微镜类型是电子显微镜，而不是光学显微镜。这一选择基于以下几个方面的考虑：
1. 分辨率与放大倍数：电子显微镜具有远高于光学显微镜的分辨率和放大倍数。光学显微镜一般最大能放大到2000倍左右，而电子显微镜的放大倍数则可高达数十万倍。由于大肠杆菌体型极小，其细微结构在光学显微镜下往往难以清晰分辨，而在电子显微镜下则能够清晰呈现。
2. 光源与成像原理：光学显微镜使用可见光作为光源，通过玻璃透镜进行聚焦和成像。而电子显微镜则利用高能短波长电子束作为照明源，并通过电磁透镜进行聚焦和放大成像。这种成像原理使得电子显微镜在观察细微结构方面具有显著优势。
3. 观察效果：在电子显微镜下，大肠杆菌的细微结构如菌毛、鞭毛等可以清晰可见。这些结构对于了解大肠杆菌的生物学特性、致病机制以及其与宿主细胞的相互作用等方面具有重要意义。而在光学显微镜下，由于放大倍数的限制和分辨率的不足，这些细微结构往往难以观察清楚。
综上所述，观察大肠杆菌时，应优先选择电子显微镜以确保观察结果的准确性和可靠性。同时，也需要注意样品制备和处理等方面的要求，以确保在电子显微镜下能够获得清晰的图像和可靠的数据。
此外，虽然光学显微镜在观察微生物方面也有一定的应用价值，但其分辨率和放大倍数的限制使得它在观察大肠杆菌等细微结构时存在一定的局限性。因此，在需要观察微生物的细微结构时，应优先考虑使用电子显微镜等更高分辨率和放大倍数的观察工具。
